1896年旗山大事
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  • 三月，台南蕃薯寮間軍事道路修築完成。
  • 三月三十一日撤廢軍政，四月一日恢復民政，全台再改為「三縣一廳」，本鎮屬於台南縣。
  • 蕃薯寮撫墾署設置，管轄對象為原住民。
  • 蕃薯寮郵便受取所設置。
  • 日本內地商人前來蕃薯寮街開設店鋪者日漸增多，各地居民亦集聚而來，房屋增加，市街頓時發展起來。
  • 日本熊本縣人津田靜一為了細川侯爵家之事業，依屯田兵方式取得今美濃鎮南部及本鎮手巾寮一帶的荖濃溪洪泛地土地的開墾。（後來開闢為南隆農場）